雖然同樣稱為壽司店，不同型態的店家在點餐方式上卻有幾種不同的模式。事先了解這些差異，第一次走進吧檯式的店家，或是接待從國外來的朋友時，都能更從容地享受用餐。
在日本，壽司店的業態大致可分為三種：交給店家與師傅決定的「omakase（主廚精選）」、自己一貫一貫挑選的「お好み（單點）」，以及連鎖型態的「迴轉壽司」。以下依序介紹各種型態。
Omakase（主廚精選） — Omakase 是師傅根據當天的進貨與時令，決定出菜順序與品項數量的用餐方式，比較接近套餐料理。有些店家不只提供壽司，還會在壽司與壽司之間穿插招牌小菜或生魚片等海鮮，讓客人享受每家店獨有的風格。一般來說，店家等級愈高，點餐方式就愈只剩下 omakase 一種選擇。順帶一提，即使是完全 omakase 的套餐，也有店家會在最後讓客人加點想吃的壽司。
有些店家在 omakase 之中，也會依價格準備幾種不同的套餐。以 omakase 為主的店家，通常會像訂位時一樣，事先決定好要選哪一種 omakase。如果訂位時店家沒有詢問，通常就表示只有一種 omakase 套餐。
Omakase 的價格基本上都會公布在網路上，可以事先確認；不過部分高級店會標示「時價」，也就是依當天的進貨價格採取浮動定價。這種情況下無法事先得知金額，建議只有在財務上有一定餘裕時再訂位。
以お好み（單點）方式點餐 — お好み是自己一貫一貫挑選想吃的壽司料點餐的方式。一邊看著展示櫃或菜單，一邊「先從白肉魚開始」、「接著來點光物」，能依自己的步調點餐是其魅力所在。中價位的店家多以這種方式為主。點餐可以用口頭表達，不過也有不少店家是讓客人寫在紙上點餐。
以お好み點餐若猶豫不決，不妨直接問師傅「今天有什麼推薦？」，許多店家也會把當天當令的壽司料寫在牆上或菜單上，可以從中挑選看看。若聽到當令壽司料的名稱卻想像不出味道，歡迎到 Sushi Guide 查詢看看。
享受迴轉壽司 — 迴轉壽司是自由拿取輸送帶上流過來的盤子，或用店內設置的觸控面板點餐的用餐方式。相較於吧檯式的店家更為輕鬆隨性，也很適合帶著家人或在旅途中順道光顧。不過自 2020 年新冠疫情在全球流行以來，讓壽司持續在輸送帶上流動的形式已大幅減少，現在有不少店家改成只能用觸控面板點餐。
從輸送帶上拿取時，看到想吃的東西可以直接輕鬆拿取。若找不到想要的壽司料，也可以透過觸控面板或出聲請師傅現做現握。迴轉壽司店深受家庭客群喜愛，因此除了傳統壽司外，也提供各式各樣的餐點。許多店家還能點到孩子們喜歡的漢堡排、薯條、拉麵等餐點。
基本上不論哪家店，桌上都會備有粉末狀茶葉與熱水龍頭沖泡的茶（あがり），可以自由飲用。此外薑片（ガリ）也會放在桌上供客人自由取用。順帶一提，大型迴轉壽司連鎖店「藏壽司」在數年前已停止提供薑片，改用蘿蔔製成的醃漬薑片。日本人對此看法不一，不過因為沒有薑那麼辣，似乎很受小朋友歡迎。像這樣享受各家店的不同之處，也是一種樂趣。
想結帳時，大多數店家只要按下觸控面板上的結帳按鈕即可。也可以把桌上的號碼牌或收據拿到櫃檯結帳。最近愈來愈多店家連結帳也能全程無人完成。
